1894年，总部设在山西运城的瑞典瑞华会（又名“秦、晋、豫信义公会”）传教士山如仁到韩城传教。1897，山如仁在县城东关外吉家寨租赁两所房院，把其中的客房作为小礼拜堂，让礼拜聚会使用。1901年，主要包含韩城和宜川两县韩城老会（韩城老会隶属于包括韩城、郃阳、澄城、宜川4县的“陕北总会”）成立，1902年，在小礼拜堂附近又购买土地8亩，在上面修建了一座约180平方米的大礼拜堂和少许客房，教堂可容纳100多信徒做礼拜。
1994年，随着教会的发展，信徒数量的增加，原来的教堂显然已不能满足信徒过信仰生活的需要，于是在原教堂的南边修建了第二座教堂。这座教堂建筑面积360平方米，一次可容纳500多信徒做礼拜。
2016年，随着信徒数量的持续增加，第二次修建的教堂又不够使用了，于是教会又在两座教堂的中间修建了第三座教堂。这座教堂长49米，宽25米，主体高度11.7米，钟楼高度34米，建筑面积5814平方米，一次可容纳1300多人做礼拜。
《圣经》说：“压伤的芦苇，他不折断；将残的灯火，他不吹灭。”（赛42:3）教堂的建设一次比一次大，越来越宏伟，这不仅见证了教会的发展、经历的坎坎坷坷，也体现了中国共产党宽大的宗教政策。1943年日机轰炸韩城县城，炸毁了教会房屋10多间；1947年国民党军158团又烧毁教会房屋45间，但1902年修建的老教堂在两次战火中均幸免于难，毫发未损。1954年，韩城县教会成立韩城县基督教三自爱国运动委员会，指导全县教会工作；“文化大革命”期间，教产被占用，教会活动因故停止；改革开放后，宗教政策得以落实，部分教产归还，于1980年教会恢复活动，1984年12月成立基督教协会。
韩城市吉家寨教堂地位重要。这个地方曾作过统管韩城和宜川教会的韩城老会，如今也是韩城市基督教三自爱国运动委员会和韩城市基督教协会的会所所在地。
韩城市吉家寨教堂历届负责人有山如仁（瑞典人）、张元壅（范家庄人，1913年）、冯世俊（富村人，1925年）、吉尚清（西原村人，1930年）、高廷壁（长老，泡泉村人，1941年）、强灵十（牧师，晨钟人，1960年）、强会望（牧师，晨钟人，1993年）及程聪智（教师，井溢村人，2007年）。
